Основна планетарна функція живої речовини полягає у створенні органічної речовини в ході фотосинтезу, тобто в зв'язуванні і запасанні (часом на дуже тривалий час) сонячної енергії, яка потім іде на підтримку безлічі інших геохімічних процесів у біосфері. За час існування життя на Землі жива речовина перетворило на потенційну енергію органічних сполук величезна кількість сонячної енергії; значна частина її в ході геологічної історії накопичилася у зв'язаному вигляді. Для сучасної біосфери характерні поклади вугілля і інших органічних речовин, що утворилися в палеозої, мезозої і кайнозої.
У біосфері в результаті життєдіяльності організмів у великих масштабах здійснюються такі хімічні процеси, як окислення та відновлення елементів зі змінною валентністю (азот, сірка, залізо, марганець та ін.) Мікроорганізми-відновники гетеротрофних, використовують як джерело енергії органічні речовини. До них відносяться денітрифікуючі і сульфатвідновлювальних бактерій, що відновлюють з окислених форм азот до елементарного стану та сірку до сірководню. Мікроорганізми-окислювачі можуть бути як автотрофами, так і гетеротрофів. Це бактерії, що окислюють сірководень і сірку, нітрит-і нітрофіцірующіе мікроорганізми, залізні і марганцеві бактерії, що концентрують ці метали у своїх клітинах.
Геологічні результати діяльності цих організмів виявляються в освіті осадових родовищ сірки, освіту в анаеробних умовах покладів сульфідів металів, а в аеробних - окислення їх і переводити у розчинний стан, виникнення залізних і залізо-марганцевих руд.
За рахунок життєдіяльності величезного числа гетеротрофів, в основному грибів, тварин і мікроорганізмів, відбувається гігантська в масштабах всієї Землі, робота по розкладу органічних залишків. При деструкції органічної маси протікають два паралельні процеси. Розкладання органічних сполук у кінцевому рахунку до вуглекислого газу, аміаку і води, а в анаеробних умовах ще й до водню та вуглеводнів представляє процес мінералізації. Продукти мінералізації знову використовуються автотрофами. Крім того, у грунті часто звільняють речовин ароматичної природи під впливом життєдіяльності мікроорганізмів знову конденсується з утворенням складного комплексу сполук - грунтового гумусу (різні гумусові кислоти та їх солі) зі значним запасом енергії. Цей процес стимулюється діяльністю багатьох грунтових груп гетеротрофів. Гумус є основою грунтової родючості. Його розкладання протікає надалі дуже повільно, під впливом певної, автохтонної мікрофлори грунтів, чим досягається постійність в забезпеченні рослин елементами мінерального живлення.
Природні води, збагачені цими продуктами мінералізації, стають хімічно високоактивними і вивітрюються гірські породи.
Процес розкладання органічних речовин, при якому звільняється хімічна енергія, характерний для всіх частин біосфери, де є живі організми, тоді як фотосинтез протікає тільки на поверхні суші й у верхньому шарі водойм. Частина органічної речовини, що попадає в умови, несприятливі для діяльності деструкторів, захоронюються і консервується в складі осадових порід, тому синтез органічних речовин в масштабі всієї біосфери не повністю врівноважується їх розкладанням.
Ця певна незбалансованість процесів синтезу і розкладання органічних речовин в біосфері визначила кисневий режим сучасної повітряної оболонки Землі.
Кисень атмосфери накопичений за рахунок фотосинтезу. Єдине джерело абіогенного надходження вільного кисню - Фотоліз молекул води у верхніх шарах атмосфери - дуже незначний. Кількість молекул О2, що виділяються зеленими рослинами, пропорційно кількості пов'язують молекул СО2. Виділений кисень знову використовується на окислення вуглецю при мінералізації органічної речовини й дихання організмів, але так як частина органічних речовин захоронюються в осадових породах, то еквівалентну кількість О2 залишається в атмосфері. Значна частина його йде на окислення мінеральних речовин. Зі збільшенням концентрації вільного кисню в повітрі витрата його на окислення мінералів зростає, із зменшенням - знижується.
У верхніх шарах тропосфери під впливом ультрафіолетового випромінювання з кисню утворюється озон. Існування озонового екрану також результат діяльності живої речовини, яка, за висловом Вернадського, "як би сама створює собі сферу життя".
Вуглекислий газ надходить в атмосферу за рахунок дихання всіх організмів. Другий, менш потужний його джерело - виділення по тріщинах земної кори з осадових порід за рахунок хімічних процесів, що відбуваються під дією високих температур; він також має біогенного походження. Частина вуглекислого газу надходить в атмосферу з абіогенного джерела - безпосередньо з мантії Землі при вулканічних виверженнях. Ця частина - лише 0,01% від СО2, виділеного живими організмами. Витрачається вуглекислий газ в процесах органічного синтезу, а також на вивітрювання гірських порід та освіта карбонатів. Вміст СО2 в атмосфері в ранній період розвитку життя було більш високим. Протягом фанерозою воно змінювалося в досить широкому діапазоні. У девоні і початку карбону, а також у пермі, за новітніми підрахунками, воно перевищувало сучасний рівень в 6-10 разів, а починаючи з середини крейди неухильно падає.
Азот атмосфери хімічно інертний, але і він бере участь у процесах синтезу і розпаду органічної речовини. Азот засвоюють з атмосфери багато прокаріотів - азотфіксатори; після їх смерті він переходить в доступні рослинам з'єднання і включається в ланцюзі харчування і розкладання.
До газів органічного походження належать також сірководень, метан і безліч інших летючих сполук, створюваних живою речовиною. Продукуючи і споживаючи газоподібні речовини, організми біосфери підтримують сталість складу повітряної оболонки Землі.
Жива речовина перерозподіляє атоми в біосфері. Багато організмів мають здатність накопичувати, концентрувати в собі певні елементи, незважаючи на часто нікчемне утримання їх у навколишньому середовищі, наприклад літотамніевие водорості накопичують у своїх тілах до 10% магнію, у раковинах брахіопод міститься близько 20% фосфору, до сірчаних бактеріях - до 10% сірки. Багато організмів концентрують кальцій, кремній, натрій, алюміній, йод і т.д.; відмираючи і захораніваясь в масі, вони утворюють скупчення цих речовин. Виникають поклади таких з'єднань, як вапняки, боксити, фосфорити, осадова залізна руда та ін
Живе речовина активно бере участь також у грандіозних процесах переміщення, міграції атомів в біосфері через систему великих і малих біогеохімічних циклів.